이름
박상민
(Park, Sang-Min)
전공
시스템생리학
연락처
연구실
시스템생리학연구실
최종학력
2006.03 ~ 2010.02 한국과학기술원 바이오및뇌공학과 [공학사] 2010.02 ~ 2012.02 한국과학기술원 바이오및뇌공학과 시스템생물학 [공학석사] 2012.09 ~ 2019.08 한국과학기술원 바이오및뇌공학과 시스템생물학 [공학박사]
경력
2019.09 ~ 2019.12 한국과학기술원 정보전자연구소 [연수연구원] 2019.12 ~ 2022.02 한국한의학연구원 한의약데이터부 [선임연구원] 2022.03 ~ 현재 충남대학교 약학대학 [조교수]
관심연구분야
생체분자 네트워크의 시스템적 동작 원리를 파악해 약물로 제어할 수 있을까? 1. 병리 기전 – 멀티 오믹스 빅데이터로부터 만성/퇴행성 질환 바이오마커 탐색 2. 약제 내성 - 네트워크 약물 반응 시뮬레이션 기반 암세포 내성 극복 전략 수립 3. 정밀 의료 – 개인 맞춤형 모델의 시스템생물학 분석 기술로 최적 치료 타겟 발굴 4. 약물재창출 – AI 인공지능 활용 천연물 작용기전 규명 및 신규 적응증 탐색
연구논문
·주저자 [최근 3년] 1. Global stabilizing control of large-scale Boolean models of biomolecular regulatory networks Bioinformatics, Accepted, 2023. 2. Sesquiterpene Lactones-Rich Fraction of Inula helenium L. Enhances the Antitumor Effect of Anti-PD-1 Antibody in Colorectal Cancer: Integrative Phytochemical, Transcriptomic, and Experimental Analyses Cancers, 15 (3), 653, 2023. 3. Systematic transcriptome analysis reveals molecular mechanisms and indications of bupleuri radix Frontiers in Pharmacology, 13, 2022. 4. Evaluating a therapeutic window for precision medicine by integrating genomic profiles and p53 network dynamics Communications biology, 5 (1), 1-13, 2022. 5. Investigation of prodromal features in metabolic syndrome based on transcriptome analysis Genes & Diseases, Published online, 2022. 6. Systematic Analysis of the Molecular Mechanisms of Cold and Hot Properties of Herbal Medicines Plants, 11 (7), 997, 2022. 7. Parkinson’s disease subtyping using clinical features and biomarkers: literature review and preliminary study of subtype clustering Diagnostics, 12 (1), 112, 2022. 8. Investigation of therapeutic response markers for acupuncture in Parkinson's disease: An exploratory pilot study Diagnostics, 11 (9), 1697, 2021. 9. Systems analysis identifies endothelin 1 axis blockade for enhancing the anti-tumor effect of multikinase inhibitor Cancer Gene Therapy, 29 (6), 1-14, 2021. 10. Feedback analysis identifies a combination target for overcoming adaptive resistance to targeted cancer therapy Oncogene, 39 (19), 3803-3820, 2020. ·공동저자 [최근 3년] 1. Bojungikki-Tang Enhances the Effect of PD-1 Blockade in a Syngeneic Murine Model of Lung Carcinoma Processes 10 (9), 1683, 2022. 2. Investigating treatment response and immune profile in association with pattern identification in NSCLC patients scheduled for immune checkpoint inhibitor monotherapy (HARMONY study): A protocol for a prospective observational study Medicine: Case Reports and Study Protocols, 3(8), e0247, 2022. 3. Bojungikki-Tang Improves Response to PD-L1 Immunotherapy by Regulating the Tumor Microenvironment in MC38 Tumor-Bearing Mice Frontiers in pharmacology, 13, 901563, 2022. 4. Identification of a novel anticancer mechanism of Paeoniae Radix extracts based on systematic transcriptome analysis Biomedicine & Pharmacotherapy, 148, 112748. 2022. 5. Genome-wide DNA methylation profiling reveals candidate biomarkers and probable molecular mechanism of metabolic syndrome Genes & Diseases, 9 (4), 833-836, 2022. 6. Circulating microRNAs as Potential Diagnostic Biomarkers for Poor Sleep Quality Nature and Science of Sleep, 13, 1001-1012, 2021. 7. Realizing cancer precision medicine by integrating systems biology and nanomaterial engineering Advanced Materials, 32 (35), 1-23, 2020.
특허
[등록] 1. EGFR 저해제 저항성 암 치료제 (An anticancer agent for treating cancers resistant to EGFR inhibitor) 2. 암의 약제 내성을 극복하기 위한 SRC 저해제의 용도 (Use of SRC inhibitor for overcoming drug resistance of cancer) 3. 부울리언 네트워크의 특정 끌개유역에 포함되는 모든 상태들을 결정하는 방법 (A method for identifying all basin states of an attractor in a Boolean network) 4. 최소한의 일시적 섭동을 사용해 부울리언 네트워크의 임의의 상태를 원하는 끌개의 끌개유역 경계 상태로 천이시키는 제어방법 (A control method for driving any state of a Boolean network to a boundary state of the basin of a desired attractor by using a minimum temporary perturbation) 5. 네트워크의 구조와 끌개유역 정보로부터 거리 비교의 복잡도를 최소화하면서 경계 상태를 찾는 최적의 방법 (An optimized method of searching a boundary state of a Boolean network with minimal complexity of distance calculation using structural information and basin information of the Boolean network) [출원] 6. 표적항암제에 대한 암의 내성 기작 분석 및 이를 극복할 수 있는 추가적인 약물 조합 표적 탐색을 위한 네트워크 시뮬레이션 방법 (A method for analyzing a resistance of targeted anti-cancer therapy and identifying a combination target to overcome the resistance using network simulation) 7. 약물 투여량에 따른 세포운명에 관한 확률을 결정하는 방법 및 이를 위한 장치 (Method for determining possibility of cell-fate according to drug dosage amount dose and device for the same) 8. 약재의 한성 및 열성 특성을 예측하는 방법 (Method and device for predicting cold property characteristics and hot property characteristics of medicines) 9. 치료에 따른 보행 장애 개선 판별용 바이오마커 및 이의 용도 (Biomarker for diagnosing improvement in gait disorder according to treatment and uses thereof) 10. 작약 추출물, 또는 이의 유래된 화합물을 유효성분으로 포함하는 오로라 키나아제 억제용 조성물 (Composition for inhibiting aurora kinase comprising as an active ingredient an extract of Paeoniae radix, or a compound derived from Paeoniae radix)